Dicat dengan warna merah, kata "VON" adalah satu-satunya yang tersisa setelah serangan teroris pada fasilitas nuklir di Jepang. Pemerintah hancur karena ketidakmampuan mereka untuk bertindak, dan polisi dengan panik mencari cara untuk menindak para pelaku. Publik tidak tahu apa-apa-sampai, enam bulan kemudian, sebuah video aneh muncul di internet. Di dalamnya, dua remaja laki-laki yang mengidentifikasi diri mereka sebagai "Sphinx" secara langsung menantang polisi, mengancam akan menyebabkan kehancuran dan kekacauan di seluruh Tokyo. Tidak dapat menghentikan kepanikan massal yang dengan cepat menyebar ke seluruh kota dan putus asa untuk mendapatkan petunjuk dalam penyelidikan mereka, polisi berjuang untuk bertindak secara efektif terhadap para teroris ini, dengan Detektif Kenjirou Shibazaki yang terjebak di tengah-tengah semuanya.Zankyou no Terror bercerita tentang Sembilan dan Dua Belas, dua anak laki-laki di balik sosok bertopeng Sphinx. Mereka seharusnya tidak ada, namun mereka berdiri tegak di dunia penuh tipu daya dan rahasia sementara mereka membuat kota runtuh di sekelilingnya, semua dengan harapan dapat mengubur kebenaran tragis mereka sendiri.