Daikichi Kawachi adalah seorang bujangan berusia 30 tahun yang memiliki pekerjaan terhormat, tetapi hidup tanpa tujuan. Ketika kakeknya tiba-tiba meninggal dunia, dia kembali ke rumah keluarganya untuk memberikan penghormatan terakhir. Setibanya di rumah itu, dia bertemu dengan seorang gadis muda misterius bernama Rin yang, yang membuat Daikichi tercengang, adalah putri haram kakeknya! Gadis pemalu dan tak bisa didekati ini dianggap memalukan bagi keluarga, dan mendapati dirinya dikucilkan oleh saudara-saudara ayahnya, semuanya menolak untuk merawatnya setelah kematiannya. Daikichi, yang marah dengan sikap dingin mereka terhadap Rin, mengumumkan bahwa dia akan mengasuhnya-meskipun dia adalah seorang pria lajang yang masih muda dan belum memiliki pengalaman mengasuh anak sebelumnya. Usagi Drop adalah kisah perjalanan Daikichi menjadi seorang ayah yang membesarkan Rin dengan sifatnya yang lembut dan penuh kasih sayang, serta eksplorasi kehangatan dan ketergantungan yang merupakan inti dari sebuah keluarga yang bahagia dan erat.