Lain Iwakura, seorang anak berusia empat belas tahun yang canggung dan tertutup, adalah salah satu dari sekian banyak anak perempuan di sekolahnya yang menerima email yang mengganggu dari teman sekelasnya, Chisa Yomoda-Chisa yang sama dengan yang baru saja bunuh diri. Lain tidak memiliki keinginan atau pengalaman untuk menangani teknologi dasar sekalipun; namun, ketika gadis fobia teknologi ini membuka email tersebut, email tersebut membawanya langsung ke dalam Wired, sebuah dunia virtual dengan jaringan komunikasi yang mirip dengan apa yang kita kenal sebagai internet. Kehidupan Lain menjadi terbalik ketika ia mulai menemukan misteri samar satu demi satu. Pria-pria aneh yang disebut Men in Black mulai muncul ke mana pun ia pergi, mengajukan pertanyaan-pertanyaan dan entah bagaimana mengetahui lebih banyak tentang dirinya daripada yang ia ketahui sendiri. Dengan batas antara dunia nyata dan dunia maya yang semakin kabur, Lain terjerumus ke dalam peristiwa-peristiwa yang lebih nyata dan ganjil di mana identitas, kesadaran, dan persepsi menjadi konsep-konsep yang memiliki makna baru. Ditulis oleh Chiaki J. Konaka, yang karyanya antara lain adalah Texhnolyze, Serial Eksperimen Lain merupakan serial misteri avant-garde psikologis yang mengikuti Lain ketika ia membuat pilihan-pilihan krusial yang akan memengaruhi dunia nyata dan dunia kabel. Dalam menutup satu dunia dan membuka dunia lain, hanya Lain yang akan menyadari pentingnya kehadiran mereka.