Sindrom Pubertas yang langka dan tidak dapat dijelaskan dianggap sebagai mitos. Ini adalah penyakit langka yang hanya menyerang remaja, dan gejalanya sangat supernatural sehingga hampir tidak ada yang mengakuinya sebagai kejadian yang nyata. Namun, seorang siswa sekolah menengah Sakuta Azusagawa tahu dari pengalaman pribadi bahwa penyakit ini sangat nyata, dan kebetulan cukup banyak terjadi di sekolahnya.Mai Sakurajima adalah seorang siswi kelas 3 SMA yang meraih ketenaran di masa mudanya sebagai aktris cilik, tetapi baru-baru ini menghentikan kariernya yang menjanjikan karena alasan yang tidak diketahui publik. Dengan aura yang sulit didekati, ia terkenal di seluruh sekolah, tetapi tidak ada yang berani berinteraksi dengannya-sampai Sakuta melihatnya berkeliaran di perpustakaan dengan kostum gadis kelinci. Meskipun berdandan, tidak ada yang memperhatikannya, dan setelah bertemu dengannya, dia menyadari bahwa dia adalah korban Sindrom Pubertas. Ketika Sakuta mencoba membantu Mai melewati kesulitannya, tindakannya membawanya ke dalam kontak dengan lebih banyak gadis yang menderita penyakit yang sulit dipahami.