Seiken Tsukai no World Break mengambil latar tempat di Akademi Swasta Akane di mana para siswa yang memiliki ingatan akan kehidupan sebelumnya dilatih untuk menggunakan Ancestral Arts sehingga mereka dapat berperan sebagai pelindung dari monster, yang disebut Metafisik, yang menyerang secara acak. Dikenal sebagai penyelamat, para siswa dibagi menjadi dua kategori: kurogane yang dapat menggunakan prana mereka untuk memanggil senjata ofensif dan kuroma yang dapat menggunakan sihir. Cerita dimulai enam bulan sebelum klimaks utama serial ini selama upacara pembukaan pada hari pertama tahun ajaran. Setelah upacara selesai, karakter utama, Moroha Haimura, bertemu dengan seorang gadis bernama Satsuki Ranjou yang mengungkapkan bahwa dia adalah adik perempuan Moroha di kehidupan lampau di mana Moroha adalah seorang pangeran heroik yang mampu membunuh seluruh pasukan dengan kemampuan pedangnya. Segera setelah itu dia bertemu dengan gadis lain, Shizuno Urushibara, yang akhirnya mengungkapkan bahwa dia juga mengenal Moroha di kehidupan masa lalu yang sama sekali berbeda di mana dia adalah penguasa kegelapan yang mampu menggunakan sihir yang merusak tetapi menyelamatkannya dari kehidupan perbudakan. Dapatkah mereka yang pikirannya hidup di masa kini dan masa lalu benar-benar mencapai masa depan yang cerah? Selami dunia Seiken Tsukai no World Break yang kompleks untuk mengetahuinya!