Takashi Natsume telah terbiasa dengan pertemuannya dengan para youkai melalui Buku Teman, yang berisi nama-nama youkai yang telah disegel oleh neneknya, Reiko Natsume, dalam sebuah kontrak. Pertemuan-pertemuan ini memungkinkan Natsume untuk lebih memahami para youkai, Reiko, dan dirinya sendiri.Buku Teman adalah alat yang ampuh yang dapat digunakan untuk mengendalikan youkai; buku ini dicari oleh para youkai dan pengusir setan. Natsume hanya ingin menjalani kehidupan sehari-harinya dengan tenang, tetapi selalu diganggu oleh pengalaman-pengalaman ini. Jika dia ingin mengakhiri siksaan ini, Natsume harus mengeksplorasi lebih lanjut tentang buku dan dunia pengusiran setan, serta mulai membuka hatinya kepada mereka yang dapat membantunya.