Di Stadion Touto, pertandingan sepak bola J. League sedang berlangsung. Saat itu, Detektif Kogorou Mouri menerima ancaman bom dari penelepon yang tidak dikenal dan teka-teki misterius yang mengarah ke lokasinya. Conan Edogawa sekarang harus menyelamatkan para penggemar pertandingan sebelum waktunya habis.Untungnya, dengan tindakan cepat dan pemikiran cerdas Conan, bom tersebut ditemukan dan ledakan dapat dihindari. Pelakunya tidak berhenti sampai di situ; Detektif Kogorou diberitahu tentang bom tersembunyi lainnya yang akan meledak di sebuah acara besar di kota. Terpaksa berpacu dengan waktu, dengan ribuan nyawa yang dipertaruhkan, Conan harus memecahkan teka-teki lain, menemukan lokasi bom tersebut, dan menangkap pelakunya untuk menghindari tragedi yang mengerikan.