Serangkaian kasus bunuh diri yang sangat mirip dan menakutkan menjadi berita utama surat kabar di Jepang pada akhir tahun 90-an. Di antara semua kemiripan yang aneh, ada satu detail yang paling menonjol di antara yang lain: semua korban bunuh diri dengan cara melompat dari gedung Fujou, sebuah bangunan tua yang sudah usang dan menjulang tinggi di atas kota.Shiki Ryougi, seorang gadis berhati dingin yang tinggal di sebuah apartemen kosong, mencurigai bahwa kejadian-kejadian menyeramkan ini memiliki penyebab supernatural. Memiliki kekuatan mistis, Shiki bekerja untuk menyelidiki kejadian-kejadian tersebut bersama Touko Aozaki, seorang detektif pembuat boneka yang berspesialisasi dalam bidang sihir, dan temannya, Mikiya Kokotou, yang bekerja sebagai asisten Touko.Shiki mengungkap misteri tersebut saat ia menjelajahi dunia yang penuh teka-teki untuk mengungkap rahasia gelap seputar fenomena aneh tersebut.