Dengan janji untuk mengabulkan permintaan apa pun, Cawan Suci yang mahakuasa memicu tiga perang di masa lalu, masing-masing terlalu kejam dan sengit untuk menyisakan pemenang. Meskipun demikian, keluarga Einzbern yang kaya raya yakin bahwa Perang Cawan Suci Keempat akan berbeda, yaitu dengan bejana Cawan Suci yang kini berada dalam genggaman mereka. Hanya karena alasan ini, "Pembunuh Magus" yang sangat dibenci, Kiritsugu Emiya, dipekerjakan oleh keluarga Einzberg, dengan pernikahan dengan putri tunggal mereka, Irisviel, sebagai kontrak yang mengikat.Kiritsugu kini berada di tengah-tengah permainan bertahan hidup yang kejam, berhadapan dengan enam peserta lain, masing-masing dipersenjatai dengan familiar kuno, dan didorong oleh keinginan dan cita-cita yang unik. Ditemani oleh familiarnya sendiri, Saber, tentara bayaran yang terkenal kejam ini segera menemukan lawan terbesarnya dalam diri Kirei Kotomine, seorang pendeta yang mencari keselamatan dari kekosongan dalam dirinya sendiri untuk mengejar Kiritsugu.Berdasarkan novel ringan yang ditulis oleh Gen Urobuchi, Fate/Zero menggambarkan peristiwa Perang Cawan Suci Keempat - 10 tahun sebelum Fate/stay night. Saksikan battle royale di mana tidak ada seorang pun yang dijamin akan selamat.