Dunia sedang sekarat, tidak lagi mampu menopang kehidupan. Keluarga Ainsworth dapat menggunakan Cawan Suci untuk menyelamatkan umat manusia, tetapi harga keselamatan adalah pengorbanan gadis ajaib Miyu - tetapi saudara laki-laki Miyu, Shirou, tidak akan membiarkan mereka memilikinya tanpa perlawanan. Sekarang terserah pada Illya untuk turun tangan dan menemukan solusi yang tidak hanya menyelamatkan Miyu, tetapi juga seluruh dunia dari malapetaka yang akan datang. Namun, ketika harga keselamatan dunia adalah nyawa seorang gadis lajang yang tak berdosa, apa yang akan dipilih Illya?