Suatu hari Nobita menemukan pohon kecil di balik bukit, namun ibunya tidak mengizinkannya untuk menanam pohon itu di halaman belakang rumah. Dengan menggunakan alat khusus Doraemon, mereka membuat pohon itu hidup sehingga bisa bergerak bebas. Nobita menamainya Ki-bō dan mereka berdua menjadi seperti saudara. Dari sana, petualangan baru menanti...