Jepang, 1988. Sebuah ledakan yang disebabkan oleh seorang anak laki-laki yang memiliki kekuatan psikis mengoyak kota Tokyo dan menyulut sumbu yang mengarah ke Perang Dunia III. Untuk mencegah kehancuran lebih lanjut, dia ditangkap dan ditahan, tidak pernah terdengar lagi kabarnya. Sekarang, di tahun 2019, versi kota yang telah dipulihkan yang dikenal sebagai Neo-Tokyo-sebuah daerah yang penuh dengan kekerasan geng dan terorisme melawan pemerintah saat ini-berdiri menggantikannya. Di sini, Shoutarou Kaneda memimpin "the Capsules," sekelompok orang aneh yang dikenal karena mengendarai sepeda motor besar dan kustom dan selalu berkonflik dengan saingan mereka "the Clowns."Dalam salah satu pertempuran ini, sahabat Shoutarou, Tetsuo Shima, terjebak dalam kecelakaan dengan seorang esper yang menemukan dirinya berada di jalanan Tokyo setelah melarikan diri dari tahanan institusi pemerintah. Melalui pertemuan ini, Tetsuo mulai mengembangkan kemampuan misteriusnya sendiri, ketika pemerintah berusaha untuk mengkarantina cenayang terbaru ini dalam upaya putus asa untuk mencegahnya melepaskan kekuatan destruktif yang sekali lagi dapat membuat kota bertekuk lutut.