Pada suatu sore yang hujan, Detective Boys menyaksikan pembunuhan di seberang jalan. Terhalang oleh lalu lintas, pelakunya menyelinap pergi dan Conan Edogawa ditinggalkan satu petunjuk oleh seorang detektif yang sekarat. Beberapa hari kemudian, seorang detektif lain ditemukan terbunuh di tempat parkir, membuat polisi kebingungan. Curiga bahwa pelakunya adalah salah satu dari mereka sendiri, semua orang di departemen kepolisian tanpa alibi dicurigai. Namun, meskipun dalam keadaan siaga tinggi, mereka kalah cepat dan mengalami serangan lain - kali ini dengan Ran Mouri yang berada dalam baku tembak.Karena trauma, Ran terbangun di rumah sakit dengan amnesia retrograde, tidak mengingat apa pun tentang kehidupannya. Setelah keluar dari rumah sakit, ia berjuang untuk mengingat masa lalunya dan menjadi takut tidak akan mendapatkan kembali ingatannya sebelum menjadi sasaran pembunuh atas apa yang ia saksikan. Saat dia dijaga oleh teman dan keluarga, terserah pada Conan untuk mengumpulkan petunjuk dan menemukan siapa pembunuhnya sebelum mereka menyerang lagi.