Digimon yang terinfeksi-monster digital yang mulai mengamuk dan mengalami peningkatan kekuatan yang aneh-menyerang dunia nyata. Sementara Maki Himekawa dan Daigo Nishijima, agen dari Badan Administratif Incorporated yang misterius, berusaha mempelajari lebih lanjut tentang kemunculan yang mengganggu ini, sebagian besar Anak Terpilih sibuk mempersiapkan festival musim panas SMA Umum Tsukishima.Mimi Tachikawa, yang baru saja kembali ke Jepang setelah tinggal di Amerika Serikat selama bertahun-tahun, berjuang untuk menemukan pijakannya di antara teman-teman sekelasnya dan sesama Anak Terpilih. Sementara itu, dengan mencurahkan perhatian pada studinya, Jou Kido dengan sengaja menghindari semua masalah yang berkaitan dengan Digimon, menyebabkan rekannya Gomamon melarikan diri. Tindakan individu Mimi dan Jou menyebabkan gesekan di dalam kelompok bahkan ketika ancaman Digimon yang terinfeksi masih membayangi mereka. Akankah keduanya menyelesaikan konflik pribadi mereka tepat waktu untuk membantu teman-teman mereka melawan ancaman terbaru?