Perang Cawan Suci: pertempuran sengit antara penyihir di mana tujuh penyihir dan pelayan yang mereka panggil memperebutkan Cawan Suci, sebuah artefak ajaib yang dapat mengabulkan permintaan apa pun. Hampir 10 tahun yang lalu, pertempuran terakhir Perang Cawan Suci Keempat mendatangkan malapetaka di Kota Fuyuki dan merenggut lebih dari 500 nyawa, membuat kota itu hancur.Shirou Emiya, seorang yang selamat dari tragedi ini, bercita-cita untuk menjadi pahlawan keadilan seperti penyelamat dan ayah angkatnya, Kiritsugu Emiya. Meskipun hanya seorang siswa, Shirou terlempar ke dalam Perang Cawan Suci Kelima ketika dia secara tidak sengaja melihat pertempuran antara pelayan di sekolah dan memanggil pelayannya sendiri, Saber.Ketika bayangan misterius memulai aksi pembunuhan di Kota Fuyuki, Shirou bersekutu dengan Rin Toosaka, sesama peserta Perang Cawan Suci, untuk menghentikan kematian banyak orang. Namun, perasaan Shirou terhadap teman dekatnya Sakura Matou membawanya lebih dalam ke dalam rahasia gelap seputar perang dan keluarga-keluarga yang terlibat di dalamnya.