Ada makhluk kegelapan dan kejahatan yang mengganggu malam, melahap manusia yang cukup malang untuk terperangkap dalam cengkeraman mereka. Di sisi lain ada Hellsing, sebuah organisasi yang didedikasikan untuk menghancurkan kekuatan supernatural yang mengancam eksistensi umat manusia. Pemimpinnya adalah Integra Fairbrook Wingates Hellsing, yang memimpin militer yang kuat dan menghabiskan hidupnya untuk memerangi mayat hidup. Pasukan Integra yang besar, bagaimanapun, tidak ada apa-apanya jika dibandingkan dengan senjata pamungkasnya: vampir Alucard, yang bekerja melawan kaumnya sendiri sebagai pemusnah Hellsing. Dengan pelayan vampir barunya, Seras Victoria, di sisinya, Alucard tidak hanya harus bertempur melawan monster, tetapi juga semua orang yang menentang Hellsing, baik yang berkedok baik maupun jahat. Dalam pertarungan demi kelangsungan hidup umat manusia, Hellsing Ultimate membuktikan bahwa penampilan tidak seperti apa yang terlihat, dan terkadang senjata terhebat dapat hadir dalam bentuk mimpi terburuk seseorang.